開放醫學資料庫
PhysioNet
PhysioNet 是一個研究資源庫,主要資源來自生理訊號相關研究領域。它於 1999 年在美國國家衛生研究院 (NIH) 的資助下成立。
在PhysioNet包含三個面向的資源:
- PhysioBank:為檔案庫,內容包含廣泛的數位化生理訊號、時間序列和相關資料。
- PhysioToolkit:為軟體庫,軟體用於生理訊號處理和分析、生理顯著事件的檢測、訊號的互動式顯示和表徵、新資料庫的建立、生理和其他訊號的模擬,以及分析方法的量化評估和比較。
- 教學材料:提供探索和分析健康資料及生理訊號的專業教學材料。
PhysioNet中常見子資料庫
- Medical Information Mart for Intensive Care (MIMIC):該資料庫包含約六萬名於2001年至2012年間入住Beth Israel Deaconess Medical Center重症監護病房的病患資料。其內容涵蓋人口統計學資料、生命體徵測量(每小時約一個數據點)、實驗室檢測結果、醫療程序、藥物、護理和醫師筆記、影像報告以及出院後死亡率 。
- eICU Collaborative Research Database (eICU-CRD):這是一個多中心資料庫,收集了2014年至2015年間美國各地超過20萬名重症監護病患的資料 。它包含類似的詳細臨床資訊,旨在促進研究社群的發展並透過眾包提高知識生成效率 。
The Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) Common Data Model (CDM)
OMOP CDM 透過提供一個標準化框架整合電子病歷 (EMR) 與行政理賠資料,允許使用者從多種來源檢索與匯整資料。OMOP CDM 是一個「以人為中心的關聯式資料模型」,每個記錄至少會連接到一個個人的身份與一個日期 ,其資料結構如下圖。
Attention
研究方法學檢驗
TRIP 資料庫
太過簡略,不考慮
這個資料庫提供一個TRIP score
,幫助使用者快速評估資料庫所蒐集的臨床指南或證據的嚴謹性與可靠性。這個分數滿分為8分,評分的方式如下:
- 方法學公開 (Methodology Publication):
- 沒有公開:0 分
- 有公開:1 分
- 有公開並提及使用 AGREE Reporting checklist (或其他類似標準):2 分
- 證據分級 (Evidence Grading - 例如使用 GRADE):
- 沒有使用:0 分
- 有使用:2 分
- 系統性證據搜尋 (Systematic Evidence Search):
- 不確定/沒有:0 分
- 有進行:2 分
- 資金透明度 (Clarity about Funding):
- 不透明:0 分
- 透明:1 分
- 利益衝突處理 (Handling Conflict of Interest):
- 沒有處理:0 分
- 有處理:1 分
Cochrane 圖書館
這個圖書館的核心目標是準備、維護並推廣系統性文獻回顧的可近性,以確保醫療專業人員、政策制定者及患者能夠獲取可靠且無偏倚的證據 。其核心資料庫主要包含以下幾個部分:
- Cochrane 系統性文獻回顧資料庫 (Cochrane Database of Systematic Reviews, CDSR):此資料庫收錄了由 Cochrane 文獻回顧小組評審的系統性文獻回顧和研究方案 。每一篇系統性文獻回顧都包含摘要、詳細的目標描述、研究納入標準、檢索策略、研究方法、研究的方法學品質、研究結果以及討論部分 。
- Cochrane 對照試驗中央登記冊 (Cochrane Central Register of Controlled Trials , CENTRAL):CENTRAL 是一個全面的對照試驗資料庫,其資訊來源包括書目資料庫(如 MEDLINE 和 EMBASE)、會議記錄以及其他難以獲取的已發表和未發表來源,包括試驗註冊中心 。
- Cochrane 臨床答案 (Cochrane Clinical Answers, CCAs):這些是針對醫療保健專業人員感興趣的各種問題提供的證據摘要,其呈現方式用戶友好,包含圖表和基於 Cochrane 文獻回顧的高層次研究結論 。
CDSR的維護使用Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions,這個教科書包含了多個工具,包含RoB 2 tool 、ROBINS-E tool (Risk Of Bias in non-randomized Studies - of Exposures)、ROB ME (Risk Of Bias due to Missing Evidence in a synthesis)......等工具。
Joanna Briggs Institute (JBI) 實證醫學資料庫
(試用申請中)
(🏗️ 未完…)